İş Deneyimi
- Yazılım Mühendisi, Google, Ağustos 2014-Şubat 2017
- Yazılım geliştirme
- Adobe Flash'tan HTML5'e çevirme aracı Swiffy'nin geliştirilmesi.
- Çizim performansının ölçümü için mekanik öğrenme modeli eğitimi.
- Cultural Institute'ta Native Client, Dlib, OpenCV ve OpenGL kullanarak yüz hatları tespiti ve çizimi.
- Yazılım Mühendisi ve Araştırma Görevlisi, eBrandValue, Mayıs 2012-Temmuz 2014
- Sosyal ağ ve marka değeri üzerine araştırma
- TÜBİTAK destekli sosyal ağ analizi ve marka değeri projesinde araştırma.
- Yazılım geliştirme
- Python ve MongoDB kullanarak eBrandValue'nun temel algoritmaların geliştirilmesi, verilerin toplanması ve analizi, web servislerinin geliştirilmesi.
- Otomatik raporlama modülünün geliştirilmesi.
- Yazılım Geliştirici, Mynet, Eylül 2010-Hâlen
- Araştırma ve geliştirme
- TÜBİTAK destekli İçeriğe ve Ücrete Duyarlı Reklam Gösterimi projesinde, Adsense benzeri bir içeriğe duyarlı reklam gösterim sisteminin Türkçe dili için Java dilinde geliştirilmesi.
- Takım liderliği
- Mynet''in reklam ağı Adklik'in yazılım ekibinin liderliği.
- Yazılım Geliştirici, EVD, Eylül 2009-Şubat 2010
- Test geliştirme
- T.C. Bayındırlık ve İskan Bakanlığı'nın yürüttüğü Binalarda Enerji Performansı Projesi'nin hesap modelinin Matlab ve Python dillerinde analizi, gerçeklenmesi ve testi.
- TÜBİTAK Destekli Tam Zamanlı Araştırma Görevlisi, İTÜ, Eylül 2006-Haziran 2009
- Biyoenformatik üzerine araştırma
- Protein ve peptitlerin dizi benzerliğine dayalı teknikler kullanılarak sınıflandırılması.
- Dizi hizalama ve Oommen-Kashyap geçiş olasılığı hesabı için Eiffel dilinde bir araç gerçeklenmesi. (http://balign.sourceforge.net/)
- Asistan Öğrenci, İTÜ Bilgi İşlem Daire Başkanlığı, Kasım 2002-Eylül 2005
- Yazılım geliştirme
- Teknik Destek
- Yazılım, sunucular, bilgisayar ağı ve PC donanımı konularında destek verilmesi.
- Stajyer, Tekstilbank Bilgi İşlem Merkezi, Ağustos 2004-Ağustos 2004
- İşletme sunucuları ve Oracle veri tabanı
- HP V-class sunucuya HP-UX 11i ve Oracle Database 10g kurulması.
- İşletme sunucuları, SAN'lar, Unix ve Oracle Veri Tabanı konularında deneyim kazanılması.
- Tekstilbank'ın sunucu ve bilgisayar ağı alt yapısının incelenmesi.
Eğitim
- Doktora, Bilgisayar Mühendisliği, İstanbul Teknik Üniversitesi, İstanbul, Türkiye, tamamlanmadı
- Yüksek Lisans, Bilgisayar Mühendisliği, İstanbul Teknik Üniversitesi, İstanbul, Türkiye, 2009
- Lisans, Bilgisayar Mühendisliği, İstanbul Teknik Üniversitesi, İstanbul, Türkiye, 2006
Yayınlar
Dergi Makaleleri
- Aygün, E.; Oommen B.J. & Cataltepe, Z. Peptide Classification Using Optimal and Information Theoretic Syntactic Modelling Pattern Recognition, 2010, 43, 3891
- Herdağdelen, A.; Aygün, E. & Bingol, H. A formal treatment of generalized preferential attachment and its empirical validation Europhysics Letters, 2007, 78, 60007
Konferans Bildirileri
- Aygün, E.; Oommen B.J. & Cataltepe, Z. On Utilizing Optimal and Information Theoretic Syntactic Modelling for Peptide Classification Pattern Recognition in Bioinformatics, 2009
- Aygün, E.; Komurlu, C.; Aydin, Z. & Cataltepe, Z. Protein Function Prediction with Amino Acid Sequence and Secondary Structure Alignment Scores International Symposium on Health Informatics and Bioinformatics, 2008
- Filiz, A.; Aygün, E.; Keskin, O. & Cataltepe, Z. Importance of Secondary Structure Elements for Prediction of GO Annotations International Symposium on Health Informatics and Bioinformatics, 2008
- Aygün E. & Cataltepe Z. Gene Ontology (GO) Molecular Function Prediction Based on Alignment Scores International Symposium on Health Informatics and Bioinformatics, 2007
- Cataltepe, Z. & Aygün, E. An Improvement of Centroid-Based Classification Algorithm for Text Classification IEEE 23rd International Conference on Data Engineering, 2007, 952-956
- Herdagdelen, A.; Aygün, E. & Bingol, H. Measuring generalized preferential attachment in an online hyper-textual dictionary: Eksi Sozluk European Conference on Complex Systems, 2005
Posterler
- Aygün, E. & Önduygu D.C. EVODES: An Evolutionary Poster Design Environment Rovereto Workshop on Cognition and Evolution, 2009
- Cataltepe, Z.; Ayan, U. & Aygün, E. Protein Function Prediction Using Motifs, Sequence Features, Alignment Scores Research in Computational Molecular Biology, 2007
- Cataltepe, Z.; Aygün, E.; Filiz, A.; Keskin, O.; Komurlu, C. & Altunbasak, Y. Dimensionality Reduction for Protein Function Prediction Automated Function Prediction – Biosapiens Joint Special Interest Group Meeting at ISMB/ECCB, 2007
Ödüller
- ODTÜ Bilgisayar Topluluğu Programlama Yarışması'nda özel ödül, 2003
- TÜBİTAK BAYG Proje Yarışması'nda bilgisayar dalında ikincilik ödülü, 2001